O número de doses depende principalmente da idade e de algumas condições especiais de saúde.

No Brasil, o Programa Nacional de Imunizações (PNI) recomenda atualmente uma única dose da vacina contra o HPV para meninas e meninos de 9 a 14 anos. Estudos demonstraram que, nessa faixa etária, uma dose proporciona proteção suficiente, razão pela qual o Brasil substituiu o antigo esquema de duas doses pela dose única.

Algumas pessoas, entretanto, necessitam de três doses, geralmente administradas no esquema 0, 2 e 6 meses. Entre elas estão pessoas imunodeprimidas, como aquelas vivendo com HIV/aids, transplantadas ou em tratamento oncológico, além de alguns outros grupos com indicação específica de vacinação.

Existem ainda situações particulares em que o esquema pode ser diferente, de acordo com a idade e a indicação da vacina. Por isso, pessoas pertencentes a grupos especiais devem seguir a orientação do Programa Nacional de Imunizações ou de seu médico.

É importante lembrar que mais doses não significam necessariamente maior proteção para quem tem indicação de dose única. Crianças e adolescentes imunocompetentes vacinados de acordo com o esquema atual não precisam receber doses adicionais apenas porque no passado eram recomendadas duas ou três doses.